EKT'nin yan etkilerinin çoğu önlenebilir. Bu yazıda, kalp-damar yan etkileri, infra, uzamış, gecikmiş ya da yetersiz nöbet, bellek sorunları, kas ağrıları, sağaltımın neden olduğu mani ve konfüzyon, nöbet içi ve nöbet sonrası deliryum gibi yan etkiler kısaca tartışılmış; yer kaplayan lezyon, kafa içi basınç artımı, kafa içi kanama, yeni miyokard enfarktüsü gibi kontrendikasyonlar gözden geçirilmiştir.